Rauhantyötä on jatkanut Ahtisaaren perustama konfliktinratkaisujärjestö CMI. Maailman kriiseistä on tullut valtioiden sisäisiä, entistä monimutkaisempia ja väkivaltaisempia.
Nobel-komitea päätti palkita Ahtisaaren työt rauhan puolesta vuonna 2008. Hän oli ollut auttamassa Indonesian hallitusta ja Acehin maakunnan kapinallisia rauhansopimukseen vuonna 2005. Ansiolistalla olivat myös ponnistelut Kosovon ja Pohjois-Irlannin konfliktien ratkaisemiseksi sekä Namibian itsenäistymisen edistäminen.
Ahtisaaren perustama CMI (Crisis Management Initiative) tekee hiljaista työtä näkymättömissä. Keskeneräisistä neuvotteluista ei kerrota mutta ei aina myöskään onnistuneista tuloksista. Toimisto on kansainvälistynyt ja työllistää nykyään 80 työntekijää.
CMI:n toimialueita ovat Lähi-itä ja Pohjois-Afrikka, Saharan eteläpuolinen Afrikka ja Euraasia eli entiset neuvostotasavallat.