Suomen vesistöt ovat pysyneet laadultaan kohtuullisina, muutoksia on lähinnä Suomenlahdella. Puhtaimpia ovat suuret järvet. Suomen Ympäristökeskus on julkaissut vesistöjen laadusta uuden kuntokartan, josta selviää esimerkiksi mökkirantojen vedenlaatu. 

Suomen Ympäristökeskus kartoittaa vesien kunnon viiden vuoden välein. Vesistöt ovat pääosin laadukkaassa kunnossa, mutta erojakin löytyy.

– Suuret järvialtaat ja pohjoisen ja idän joet ovat hyvässä kunnossa. Vähän heikommassa kunnossa olevia vesiä on varsinkin etelässä ja Pohjanmaalla sekä merialueet etelässä, kertoo limnologi Sari Mitikka, Suomen Ympäristökeskuksesta.

Heikennykset veden laadussa huomaa yleensä levälautoista ja veden samentumisesta. Myös kalansaalit särkivaltaistuvat. Muutokset johtuvat vesistöjen rehevöitymisestä.