Hiljenevän järven biologiassa tapahtuu syksyllä paljon. Vedessä tapahtuu täyskierto ja myös eläimet valmistautuvat talveen.
Syysmyrskyt sekoittavat järvien vesipatsaan, ja kun vesi on jäähtynyt 4 asteeseen, tapahtuu veden syystäyskierto. Vesimassat sekoittuvat pinnalta pohjaan. Samalla veden pohjaan kulkeutuu happea ja pintaan ravintoaineita.
Syyskierto on elinehto järvien eliöiden talvehtimiselle. Järvien eläimet alkavat valmistautua talven tuloon syksyllä. Esimerkiksi piisamit ja majavat kunnostavat pesiään talvenkestäviksi ja täyttävät ruokavarastojaan.